Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxp4Q9DBY0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp4Q9DBY0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms