Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pop5Q9DB28 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms