Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34b2Q9D9N2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms