Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx5Q9D8U8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms