Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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