Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms