Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms