Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem88Q9D0N8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tmem88Q9D0N8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tmem88Q9D0N8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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