Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc3Q9CXE6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xrcc3Q9CXE6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc3Q9CXE6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms