Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx10Q9CWT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms