Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctrb1Q9CR35 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctrb1Q9CR35 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms