Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riok2Q9CQS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riok2Q9CQS5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms