Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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