Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufb9Q9CQJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms