Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms