Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtn4Q99P72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms