Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkd1Q99MH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms