Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab28Q99KL7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms