Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me2Q99KE1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms