Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn16Q925N4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn16Q925N4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn16Q925N4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn16Q925N4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn16Q925N4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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