Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfxn4Q925N1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfxn4Q925N1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms