Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms