Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms