Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a4Q91VA1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a4Q91VA1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms