Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RestQ8VIG1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RestQ8VIG1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms