Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng5Q8VHW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms