Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms