Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms