Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms