Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim29Q8R2Q0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms