Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms