Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg10Q8R1P4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms