Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms