Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd3Q8K2F0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms