Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh3Q8K1E6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh3Q8K1E6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms