Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33aQ8K0Y2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms