Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Afg3l2Q8JZQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l2Q8JZQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms