Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip10Q8CJ53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms