Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcerg1Q8CGF7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcerg1Q8CGF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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