Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms