Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC106179Q8C9L1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms