Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cwc22Q8C5N3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc22Q8C5N3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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