Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot2Q8C5L3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms