Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms