Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim35Q8C006 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim35Q8C006 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms