Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR70

Yipf6, Protein YIPF6, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf6Q8BR70 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Yipf6Q8BR70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Yipf6Q8BR70 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Yipf6Q8BR70 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yipf6Q8BR70 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Yipf6Q8BR70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Yipf6Q8BR70 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yipf6Q8BR70 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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