Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms