Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap100Q80VN0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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