Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms