Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms